هوش مصنوعی الفبت تمام پروتئین های شناخته شده را ترسیم كرد
امید به درمان همه بیماری ها به دست هوش مصنوعی
به گزارش لینک بگیر پایگاه داده ساختار پروتئین شرکت ˮالفبتˮ معروف به ˮآلفا فولدˮ حالا شامل بیشتر از ۲۰۰ میلیون پروتئین شناخته شده است که امیدها را برای درمان انواع بیماری ها زنده نگه می دارد.
به گزارش لینک بگیر به نقل از ایسنا و به نقل از نیو اطلس، سال گذشته، هوش مصنوعی شرکت "الفبت"(Alphabet) به نام "دیپ مایند"(DeepMind)، یک پایگاه داده منبع باز از ساختارهای سه بعدی صدها هزار پروتئین همچون تمام ۲۰ هزار پروتئین شناخته شده در بدن انسان منتشر نمود. حالا این پایگاه داده معروف به "آلفا فولد" به ۲۰۰ میلیون نمونه گسترش یافته است که تقریباً میتوان گفت تمام پروتئین های شناخته شده در دنیای علم را شامل می شود.
پروتئین ها عامل فعالیت سلول های زنده هستند که تعداد بی شماری از فرآیندهای بیولوژیکی حیاتی در راه حیات را انجام می دهند. آنها از زنجیره ای از اسیدهای آمینه تشکیل شده اند که به شکل های سه بعدی پیچیده می شوند که عملکرد آنها را دیکته می کند. ترسیم ساختار پروتئین ها برای درک این که چه کاری انجام می دهند، چگونه کار می کنند و این که چگونه امکان دارد چیزی اشتباه جلو برود، مهم می باشد. شناخت و ترسیم پروتئین ها برای تحقیق درمورد همه چیز، از داروها و درمان های جدید گرفته تا بهبود محصولات کشاورزی و محافظت از حیوانات، کلیدی است.
اما محاسبه ساختار دقیق یک پروتئین بر مبنای اسیدهای آمینه تشکیل دهنده آن دشوار است. پی بردن به این مورد معمولا به مقدار زیادی قدرت محاسباتی و ساعات کار سرسام آور انسانی نیاز دارد، در صورتیکه این وضعیت به «مشکل تاخوردگی پروتئین» معروف شده است. به این ترتیب، پیشرفت در این عرصه در طول دهه های اخیر نسبتاً کند بوده است.
حالا میتوان گفت این مشکل تا زمانی مشکل بود که شرکت "الفبت" که شرکت مادر "گوگل" است، هنوز هوش مصنوعی قدرتمند خود معروف به "دیپ مایند" را روی این مشکل تنظیم نکرده بود. این سیستم که در ابتدا با ۱۰۰ هزار ساختار پروتئینی شناخته شده آموزش دیده بود، توانایی پیشبینی ساختار میلیونها پروتئین دیگر را توسعه داد که تعیین و ترسیم هر یک از آنها به جای ماه ها یا سال ها، تنها چند دقیقه یا چند ثانیه زمان می برد.
در ژوئیه ۲۰۲۱ نخستین پایگاه داده ساختار پروتئین "آلفا فولد" برای عموم منتشر گردید. این پایگاه داده در ابتدا حاوی بیشتر از ۳۵۰ هزار ساختار پروتئینی بود که حدود ۹۸.۵ درصد از پروتئین های انسانی و همینطور پروتئین های موجود در مگس های میوه، موش ها، مخمرها و باکتری های "ای. کولی"(E.coli) را شامل می شد. بعدها به حدود یک میلیون ساختار پروتئینی از ۱۰ هزار گونه جانوری، گیاه، باکتری، قارچ و سایر موجودات گسترش یافت.
حالا ظرف یک سال بعد از آن رویداد، بیشتر از ۵۰۰ هزار دانشمند از سراسر جهان برای کمک گرفتن در تحقیقات خود به این پایگاه داده دسترسی پیدا کرده اند.
حالا "دیپ مایند" یک بروزرسانی بزرگ جدید برای پایگاه داده خود منتشر نموده است که هم اکنون شامل حدود ۲۱۴ میلیون ساختار از یک میلیون گونه است. این عدد یعنی تقریباً تمام پروتئین هایی را که هم اکنون برای علم شناخته شده است، پوشش می دهد و برای تحقیق درمورد درمان بیماریها، واکسن ها، پایداری، مقاومت آنتی بیوتیکی و حتی آلودگی پلاستیکی موهبت بزرگی را عرضه می دهد.
"اریک توپول"، مدیر مؤسسه تحقیقاتی "اسکریپس" می گوید: "آلفا فولد" قبلاً اکتشافات عظیمی همچون شکستن ساختار مجتمع منافذ هسته ای را تسریع و فعال کرده است و با افزودن این ساختارهای جدید که تقریباً کل جهان پروتئین ها را روشن می کند، می توانیم انتظار داشته باشیم که اسرار بیولوژیکی بیشتری هر روز رمزگشایی شود.
قابل ذکر است که کل پایگاه داده ساختارهای پروتئین، متشکل از بیشتر از ۲۵ ترابایت داده را میتوان از مجموعه داده های عمومی Google Cloud دانلود کرد.
این مطلب را می پسندید؟
(0)
(0)
تازه ترین مطالب مرتبط
نظرات بینندگان در مورد این مطلب